Adıyaman ili badem ağaçlarında önemli Prunus virüslerinin DAS-ELISA ve RT-PCR analizleri ile saptanması ve karakterizasyonu

نویسندگان

چکیده

Amaç: Bu çalışmada, Adıyaman ili genelinde yetişen badem ağaçlarında apple mosaic virus (ApMV), prunus necrotic ring spot (PNRSV), prune dwarf (PDV), plum pox (PPV) ve chlorotic leaf (ACLSV)’lerinin Double Antibody Sandwich-Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (DAS-ELISA) Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) yöntemleriyle belirlenmesi, elde edilen virüs izolatlarının filogenetik ilişkilerinin ortaya konulması amaçlanmıştır.Yöntemler Bulgular: ilinde ağaçlarından simptomlu simptomsuz bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan tüm örnekler DAS-ELISA RT-PCR yöntemleri ile testlenmiştir. analizi sonucunda 34 örneğin yalnız PDV enfekteli olduğu saptanmış, ancak testlenen örneklerde diğer virüsler bulunmamıştır. izolatları doğrudan sekanslanmıştır. Nükleotid sekansları birbiriyle GenBank'ta depolanan karşılaştırılarak olarak analiz edilmiştir. ağaçta yüksek homolojiyle aynı grupta yer aldığı, GenBank’a kayıtlı izolatlarından ise farklı bir kümelendiği belirlenmiştir. çalışma PDV’nin saptanması konusundaki ilk çalışmadır. 15 tanesi MW357407-MW357421 erişim numaraları GenBankası’na kaydedilmiştir.Genel Yorum: Adıyaman'da (PDV)’unun varlığı, hem de testleri kez bu kanıtlanmıştır. ağaçlarının %30,90 oranında bulaşık olması, bölgede plantasyonlarının kurulması sırasında önlem alınması gerektiğini göstermektedir. Test örneklerinde ACLSV, ApMV, PNRSV PPV tespit edilmediğinden, ileride yapılacak çalışmalar daha geniş alanları tarayarak örnek sayısının artırılması virüslere özgü primer çiftleri kullanılarak yeni testlerin yapılması gerekmektedir. Çalışmanın Önemi Etkisi: önemli Prunus virüslerinin tespiti karakterizasyonu yapılmıştır.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Koyun ve Sığırlardan İzole Edilen Arcanobacterium pyogenes Suşlarının Moleküler Karakterizasyonu

The purpose of this study was to determine the presence of virulence genes, perform typing for the characterization of Arcanobacterium pyogenes field strains, and investigate the correlation between clonal types, virulence genes and occurence of disease. The isolates (n=51) used in this study were isolated from different sources (liver (n=4) of sheep; liver (n=25), lungs (n=5), broncho-alveolar...

متن کامل

Koyunlarda Haemonchus contortus’un Moleküler Prevalansı, Filogenetik Karakterizasyonu ve Benzimidazol Dirençliliği

This study was conducted to determine the molecular prevalence and characterization of Haemonchus contortus from sheep along with the benzimidazole (BZ) resistance in H. contortus populations. Fecal samples were collected from a total of 300 sheep in research area and analyzed by fecal flotation. qPCR assays were utilized on trichostrongylid egg positive samples in order to identify H. contortu...

متن کامل

Comparison of DAS-ELISA and RT-PCR Methods for the Detection of Prunus Necrotic Ringspot Virus (PNRSV)

Two methods (DAS-ELISA and RT-PCR) were compared for the detection of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) in woody host Prunus mahleb isolated from Malatya. Total RNA extractions were made from serially diluted fresh leaf tissue, root, bark and one year old green bark tissue using silica-based method. Purified total RNA extracts were used as template for cDNA synthesis by reverse transcripti...

متن کامل

Bazı evcil hayvanlarda albuminin elektroforetik ve boya bağlanma yöntemleri ile karşılaştırmalı tayini ve spesifitelerinin belirlenmesi

Özet: Günümüzde albumin tayininde genellikle bromocreosol purple (BCP) ve bromocreosol green (BCG) gibi fitalein boyalar kullanılmaktadır. Ancak bu yöntemlerde albuminin boya bağlanma affinitesi türlere göre farklılıklar göstermekte, preanalitik ve analitik faktörler de sonuçlar üzerinde etkili olmaktadır. Bu çalışmada domuz, sığır ve koyunda albumin düzeylerinin BCP ve BCG boya bağlanma yöntem...

متن کامل

Damızlık Tavuk Kümeslerinde Mycoplasma gallisepticumve Mycoplasma synoviae’nin Gerçek Zamanlı PCR’lar ile ve Mycoplasma gallisepticum Antikorlarının ELISA ile Tespiti

This study aimed to determine the prevalence of Mycoplasma gallisepticum (MG) and Mycoplasma synoviae (MS) in breeder flocks showing respiratory symptoms. A total of 77 flocks (2153 tracheal swabs and blood samples) were sampled and all were tested by MG real time PCR (MG-rPCR) and MG-ELISA, and 32 flocks were tested by MS real time PCR (MS-rPCR). In the first part of this study covering 28 flo...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Mustafa Kemal U?niversitesi tar?m bilimleri dergisi

سال: 2021

ISSN: ['2667-7733']

DOI: https://doi.org/10.37908/mkutbd.923357