Adıyaman ili badem ağaçlarında önemli Prunus virüslerinin DAS-ELISA ve RT-PCR analizleri ile saptanması ve karakterizasyonu
نویسندگان
چکیده
Amaç: Bu çalışmada, Adıyaman ili genelinde yetişen badem ağaçlarında apple mosaic virus (ApMV), prunus necrotic ring spot (PNRSV), prune dwarf (PDV), plum pox (PPV) ve chlorotic leaf (ACLSV)’lerinin Double Antibody Sandwich-Enzyme Linked Immuno Sorbent Assay (DAS-ELISA) Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) yöntemleriyle belirlenmesi, elde edilen virüs izolatlarının filogenetik ilişkilerinin ortaya konulması amaçlanmıştır.Yöntemler Bulgular: ilinde ağaçlarından simptomlu simptomsuz bitki örnekleri toplanmıştır. Toplanan tüm örnekler DAS-ELISA RT-PCR yöntemleri ile testlenmiştir. analizi sonucunda 34 örneğin yalnız PDV enfekteli olduğu saptanmış, ancak testlenen örneklerde diğer virüsler bulunmamıştır. izolatları doğrudan sekanslanmıştır. Nükleotid sekansları birbiriyle GenBank'ta depolanan karşılaştırılarak olarak analiz edilmiştir. ağaçta yüksek homolojiyle aynı grupta yer aldığı, GenBank’a kayıtlı izolatlarından ise farklı bir kümelendiği belirlenmiştir. çalışma PDV’nin saptanması konusundaki ilk çalışmadır. 15 tanesi MW357407-MW357421 erişim numaraları GenBankası’na kaydedilmiştir.Genel Yorum: Adıyaman'da (PDV)’unun varlığı, hem de testleri kez bu kanıtlanmıştır. ağaçlarının %30,90 oranında bulaşık olması, bölgede plantasyonlarının kurulması sırasında önlem alınması gerektiğini göstermektedir. Test örneklerinde ACLSV, ApMV, PNRSV PPV tespit edilmediğinden, ileride yapılacak çalışmalar daha geniş alanları tarayarak örnek sayısının artırılması virüslere özgü primer çiftleri kullanılarak yeni testlerin yapılması gerekmektedir. Çalışmanın Önemi Etkisi: önemli Prunus virüslerinin tespiti karakterizasyonu yapılmıştır.
منابع مشابه
Koyun ve Sığırlardan İzole Edilen Arcanobacterium pyogenes Suşlarının Moleküler Karakterizasyonu
The purpose of this study was to determine the presence of virulence genes, perform typing for the characterization of Arcanobacterium pyogenes field strains, and investigate the correlation between clonal types, virulence genes and occurence of disease. The isolates (n=51) used in this study were isolated from different sources (liver (n=4) of sheep; liver (n=25), lungs (n=5), broncho-alveolar...
متن کاملKoyunlarda Haemonchus contortus’un Moleküler Prevalansı, Filogenetik Karakterizasyonu ve Benzimidazol Dirençliliği
This study was conducted to determine the molecular prevalence and characterization of Haemonchus contortus from sheep along with the benzimidazole (BZ) resistance in H. contortus populations. Fecal samples were collected from a total of 300 sheep in research area and analyzed by fecal flotation. qPCR assays were utilized on trichostrongylid egg positive samples in order to identify H. contortu...
متن کاملComparison of DAS-ELISA and RT-PCR Methods for the Detection of Prunus Necrotic Ringspot Virus (PNRSV)
Two methods (DAS-ELISA and RT-PCR) were compared for the detection of Prunus necrotic ringspot virus (PNRSV) in woody host Prunus mahleb isolated from Malatya. Total RNA extractions were made from serially diluted fresh leaf tissue, root, bark and one year old green bark tissue using silica-based method. Purified total RNA extracts were used as template for cDNA synthesis by reverse transcripti...
متن کاملBazı evcil hayvanlarda albuminin elektroforetik ve boya bağlanma yöntemleri ile karşılaştırmalı tayini ve spesifitelerinin belirlenmesi
Özet: Günümüzde albumin tayininde genellikle bromocreosol purple (BCP) ve bromocreosol green (BCG) gibi fitalein boyalar kullanılmaktadır. Ancak bu yöntemlerde albuminin boya bağlanma affinitesi türlere göre farklılıklar göstermekte, preanalitik ve analitik faktörler de sonuçlar üzerinde etkili olmaktadır. Bu çalışmada domuz, sığır ve koyunda albumin düzeylerinin BCP ve BCG boya bağlanma yöntem...
متن کاملDamızlık Tavuk Kümeslerinde Mycoplasma gallisepticumve Mycoplasma synoviae’nin Gerçek Zamanlı PCR’lar ile ve Mycoplasma gallisepticum Antikorlarının ELISA ile Tespiti
This study aimed to determine the prevalence of Mycoplasma gallisepticum (MG) and Mycoplasma synoviae (MS) in breeder flocks showing respiratory symptoms. A total of 77 flocks (2153 tracheal swabs and blood samples) were sampled and all were tested by MG real time PCR (MG-rPCR) and MG-ELISA, and 32 flocks were tested by MS real time PCR (MS-rPCR). In the first part of this study covering 28 flo...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Mustafa Kemal U?niversitesi tar?m bilimleri dergisi
سال: 2021
ISSN: ['2667-7733']
DOI: https://doi.org/10.37908/mkutbd.923357